Ακτινολογική απεικονιστική μέθοδος χωρίς την εφαρμογή ακτινοβολίας. Χρησιμοποιεί ισχυρό μαγνητικό πεδίο για την απεικόνιση ιστών και ανατομικών σχηματισμών με μεγάλη λεπτομέρεια. Στην νευρολογία χρησιμοποιείται συνήθως για την απεικόνιση του εγκεφάλου, του νωτιαίου μυελού στην σπονδυλική στήλη, με ή την χορήγηση ενδοφλέβιου σκιαγραφικού για την αύξηση της διαγνωστικής ακρίβειας της εξέτασης. Διαρκεί 20-40 λεπτά κατά μέσο όρο αναλόγως της περιοχής που εξετάζεται καθώς και των ευρημάτων. Κάποιοι ασθενείς ζητούν ανοικτούς μαγνητικούς τομογράφους λόγω αίσθημα κλειστοφοβίας αλλά γενικά τα σύγχρονα μηχανήματα είναι πιο άνετα και γρηγορότερα στην επεξεργασία των εικόνων, οπότε και πιο εύκολα ανεκτά.